La UD Melilla está representada en todas las categorías federativas del fútbol formativo: desde los prebenjamines hasta los juveniles. Bajo la contienda de expandir nuestra filosofía y valores deportivos al fútbol base melillense, tenemos fidelidad con el club C.D. Milenium F.S. para que vistan nuestros colores y lleven nuestro escudo en sus equipaciones.

Más allá del césped, también participamos en las competiciones federadas de fútbol sala y fútbol playa.

Cada temporada la cantera unionista siempre acaba con algún título en sus manos. Sin embargo, pese a los resultados conseguidos, lo primordial en la fase formativa de un futbolista es representar correctamente los valores que tiene la Unión Deportiva Melilla.